Gertine Hoefnagel is werkzaam als organist, kerkmusicus, docent en koordirigent. Ze is organist van het Ikazia Ziekenhuis Rotterdam, cantrix van de Protestantse Gemeente Voorschoten en de Protestantse Gemeente Pijnacker & dirigente van het Christelijk Oratoriumkoor Woerden en DoReVocaal Zwolle.

Ze heeft een eigen lespraktijk en werkt op de muziekscholen van Urk en Veenendaal.